造成学习困难的原因是多方面的，都是由于内部因素和外部因素导致的，到目前为止，儿童学习困难的原因如下：
1.生理因素：
一、胎儿期或者出生后因疾病、损伤引起的轻度脑损伤或者轻度脑功能障碍。
二、遗传因素。有些学习技能障碍具有遗传性，如儿童的父亲、爷爷或其他亲属可见到类似情况。
三、身心发展落后于同龄儿童的发展水平。乳牙脱得慢、走路说话迟、个子特别矮小等；感觉器官功能的缺陷或运动协调功能差。
四、身体疾病。如果孩子身体虚弱，生病，经常旷课，就会中断所学课程的连续性，学习内容不连贯，自然会导致学习困难；有的孩子在课堂上有很多小动作，或者存在注意力缺陷，不能集中注意力，这也会导致学习困难。
2.环境因素：
（1）家庭环境恶劣。 由于父母长期在外工作或家庭成员关系紧张等原因，使儿童从小就未得到大人充分的爱抚，特别是缺乏母爱。
（2）儿童在幼年时没有得到良好的教育，在儿童早期成长和发展的关键时期没有提供丰富的环境刺激和教育。
（3）不适当的学习内容和教学方法，使孩子产生厌学情绪。有些父母望子成龙心切，他们拔苗助长，不按儿童的身心特点进行教育，常在是教育的内容、方式、方法上违反教育规律。如学后儿童小学化，小学儿童初中化等。
3.营养与代谢：
研究证明，儿童学习困难与营养代谢有关，部分微量元素不足或饮食不合理，营养失衡会影响智力发育。过去认为碘摄入量不足影响儿童智力，锂元素影响儿童个性特征，进而影响学习。有研究表明，学习困难儿童发中微量元素锌、铜的含量显着低于正常儿童，而铁也是影响学习成绩的重要因素。
4.心理因素：
儿童的学习困难与心理因素密切相关，有学习困难的儿童有普遍的心理问题。学习动机水平低学习动力不足，学习兴趣差，情绪易波动，意志障碍，认知障碍，自我意识水平低等。
